Son yıllarda sağlık bilimleri alanında probiyotikler üzerine yapılan çalışmalar giderek artmaktadır. Bu bağlamda, Tibet kefir tanelerinden izole edilen Lactiplantibacillus plantarum 12-3 suşu, probiyotik olarak kullanılma potansiyeli yüksek olmasına rağmen henüz tam olarak değerlendirilmemiştir. Bu çalışma, genetik çeşitliliği, CRISPR-Cas mekanizması ve probiyotik işlevselliği gibi özelliklerini daha iyi anlayabilmek için yapılmıştır.
Genomik Analiz ve Çeşitlilik
Araştırma kapsamında, L. plantarum 12-3’ün genomik DNA’sı, Illumina ve Tek Molekül Gerçek Zamanlı (SMRT) teknolojileri kullanılarak çıkarılmış ve dizilenmiştir. Yapılan pan-genom ve filogenetik analizler ile suşun genetik çeşitliliği ve taksonomik kimliği doğrulanmıştır. Genomun 3.4 Mb büyüklüğünde olduğu ve 3234 gen içerdiği tespit edilmiştir. Bu genlerin normal uzunlukta ve ara genik boşluklara sahip olduğu belirlenmiştir.
Gıda Güvenliği ve Antibiyotik Direnci
Gıda güvenliği açısından yapılan analizler, L. plantarum 12-3’ün probiyotik olarak kullanımına uygun bir antibiyotik direnç profili sunduğunu ortaya koymuştur. Ayrıca, antimikrobiyal duyarlılık testleri ve virülans gen tanımlama çalışmaları da gerçekleştirilmiştir. Genomik adalar, insertiyon dizileri ve profajların analizi, bu genetik bileşenlerin evrim üzerindeki olası etkileri hakkında bilgi sağlamıştır.
Önemli Çıkarımlar
- L. plantarum 12-3, genetik çeşitliliği ve sağlam antibiyotik direnç profili ile dikkat çekmektedir.
- Probiyotik olarak kullanım potansiyeli, geniş kapsamlı in vitro ve in vivo çalışmalarla desteklenmelidir.
- CRISPR-Cas gibi savunma mekanizmaları, gelecekteki genom mühendisliği çalışmaları için umut verici görünmektedir.
Sonuç olarak, Lactiplantibacillus plantarum 12-3’ün genomik yapısı ve işlevsel özellikleri üzerine yapılan bu detaylı çalışma, probiyotik olarak kullanılabilirliğini artırmak için ileri seviye araştırmaların yapılmasını gerektirmektedir. Ayrıca, bu suşun diğer probiyotik türlerle karşılaştırmalı analizleri, genetik çeşitlilik ve işlevsel özellikler hakkında daha fazla bilgi sağlayabilir.
Orijinal Makale: Front Biosci (Landmark Ed). 2024 Apr 11;29(4):147. doi: 10.31083/j.fbl2904147.
