AHPND, karides çiftliklerinde ciddi ekonomik kayıplara yol açan akut bir bakteriyel hastalıktır. Bu hastalığın, karideslerin mide ve bağırsaklarındaki bakteriyel imzalarla olan ilişkisi tam olarak anlaşılmamıştır. Bu araştırma, AHPND’nin doğal olarak meydana geldiği durumlarda karideslerin mikrobiyom yapısını yüksek verimli sekanslama (HTS) yöntemiyle karakterize etmeyi amaçlamaktadır.
Araştırmada, ticari bir çiftlikten toplanan karides örnekleri, sağlıklı ve AHPND’den etkilenen iki gruba ayrıldı. PCR ile doğrulanan bu örneklerin mide ve bağırsak mikrobiyomları, 16S rRNA geninin V3-V4 bölgesini hedefleyen analizlerle incelendi. PERMANOVA analizleri, bu iki sağlık durumunda mide ve bağırsak mikrobiyomları arasında anlamlı bir farklılık olduğunu ortaya koydu.
Vibrio Türlerinin Rolü
Sonuçlar, AHPND’den etkilenen karideslerin bağırsaklarında Vibrio brasiliensis ve V. sinaloensis’in belirgin bir şekilde fazla olduğunu gösterdi. Bu bakteri türlerinin, hastalığın enfeksiyon sürecinde önemli bir rol oynadığı düşünülmektedir. Bu dengesizlik, sağlıklı karideslerin bağırsaklarında bol miktarda bulunan Pseudoalteromonas, Gilvimarinus ve diğer Pseudomonadota üyelerinin varlığı ile hafifletilebilir.
Sağlıklı Mikrobiyomun Önemi
Çalışma, sağlıklı bağırsak mikrobiyomunda bulunan Cellvibrionaceae, Psychromonadaceae ve Halieaceae gibi bakteri gruplarının AHPND’yi önlemekte önemli olabileceğini göstermektedir. Bu bulgular, karides mikrobiyomunun detaylı dinamiklerini anlamamıza yardımcı olarak, hastalığın ilerleyişi konusunda derin bir anlayış sunmaktadır.
Uygulanabilir Çıkarımlar
– AHPND’nin kontrolünde mikrobiyom analizi kritik rol oynayabilir.
– Sağlıklı mikrobiyomun korunması, hastalığın önlenmesinde etkili olabilir.
– Probiotiklerin kullanımı, AHPND yönetiminde yeni bir yol açabilir.
– Yüksek verimli sekanslama, karides sağlığını izlemek için güçlü bir araçtır.
Bu çalışma, AHPND’nin yönetimi için probiyotiklerin gelecekteki tanımlanması ve daha etkili yönetim stratejileri geliştirilmesine zemin hazırlamaktadır.
Orijinal Makale: Heliyon. 2024 Jun 15;10(12):e33034. doi: 10.1016/j.heliyon.2024.e33034. eCollection 2024 Jun 30.
